一般诊所分为综合性诊所和传染病诊所两大类，所排放的污水与一般市政污水相近，但不完全一致，因医疗污水中含有消毒剂、药物、诊断用品等市政污水中不含的污染物。医院污水中若是由传染病房、手术室、洗衣房所排出的污水，更是含有大量的病原微生物、寄生虫、各种病菌，还含有大量的污染物，其中有机物质占污染总量的60%左右，不溶解物质约占总量的40%，由于大量不容物质沉淀，会将比重较大的蠕虫及其大量细菌等一起沉淀在污泥中。因此，医疗废水需要经过消毒脱污处理后才可排放。
一、医疗污水所含物质
处理医疗废水的方法和工艺流程是按照废水中所含不同的物质而确定，医疗废水中一般处理污染物有漂浮物、寄生虫、有机物、病菌病毒等。
2.1、悬浮物及飘浮物
污水流入化粪池后，比重较大的污染物将会发酵消化，沉淀分离。沉降时一些病菌病毒也会随着沉降，因此污泥也应相对做出处理。化粪池出水会携带部分杂质和漂浮物流进消毒池，这将会影响消毒剂的效果，所以在污水进入化粪池之前应得到充分的沉淀和进行过滤。
2.2、寄生虫
寄生虫卵来源于粪便中，其比重大于粪便污水（约1.20～1.04），故可通过沉淀将其从污水中分离。一般用蛔虫卵作为寄生虫的死亡标准，即当蛔虫卵死亡时，便认为其他虫卵均已死亡。蛔虫卵在外界可活1～5年，但在发酵环境中，生命期则大大缩短。在堆积的粪便中，夏天能活7天，冬天能活21天。常采用的化粪池，污泥清掏周期在3个月以上，寄生虫卵完全可以在池中沉淀，在发酵环境中杀灭。
2.3、有机污染物
医疗污水的有机物浓度一般小于城市污水，BOD多在100mg/L左右，可以利用水体本身的自净能力将其消化。但如果直接排入要求较高的地表水体、风景区等时，则对其有机物要进行处理，一般多采用生物处理法。
2.4、病毒
病毒是一种比细菌小，没有完整细胞结构的物体，病毒必须在活细胞才能生存繁殖。人类80%的传染病是由病毒引起的。大部分病毒耐寒不耐热，但对温煮沸和强氧化剂（如臭氧）都很敏感，因此可以投加一定浓度的臭氧使其灭活。
2.5、传染病菌
传染病菌虽然种类很多但活动规律大同小异，一般在pH值5~9.6范围内生存，离开此pH值则不能存活，传染病菌在清水中一般能存活1个月左右，但在粪便污水中生存时间较短，这是因为粪便污水中含自身分解的氨，有杀菌的作用；大便分解会产生一些灭菌素，灭活病菌；一般化粪池处于密封状态，而病菌生性好氧，池内密封补氧困难，是好氧病菌在缺氧的环境下自行死亡。
二、医疗污水处理工艺流程：整个处理医疗污水的工艺可分两级处理。
3.1、一级处理
粪便污水→化粪池→调节池（加臭氧）→混合器→延时反应器→清水池→排入下水道→（污泥→污泥场→消毒排出）。
主要环节是消毒灭菌后可排入城市污水，然后进入城市污水处理厂，进行深度处理。
3.2、二级处理
粪便污水→化粪池→调节池→生物处理→混合器（加臭氧）→延时反应器→清水池→排入水体→（污泥→污泥场→消毒排出）。
三、医疗污水用臭氧消毒与其它方式消毒的比较
（1）、臭氧消毒克服了其它消毒方式在运输、储存和处理过程中的危险；
（2）、臭氧消毒接触时间很短，且能改善水质，是一种优良的消毒剂；
（3）、臭氧能杀灭其它消毒方式如氯等不能杀灭的病毒、芽孢等；
（4）、臭氧消毒作用不受废水中氨氢含量及pH值的影响；
（5）、臭氧可以廉价的空气或氧气为气源制备而得；
（6）、由于近年三二二公司臭氧设备不断改进升级，现今三二二臭氧发生器能耗大大降低，体积越来越小，运行稳定性很大
提高，加之目前电费较低，电能充足，因而臭氧在污水处理上的应用愈来愈占有明显的优势；
（7）、具有价格优势。如今的臭氧发生器的价格与次氯酸钠、氯、二氧化氯发生器的价格相当。
所以，选择臭氧消毒是一种经济可行的方法
臭氧处理工艺
臭氧处理可以杀灭细菌繁殖体和芽胞、病毒、真菌等，并可破坏内毒杆菌毒素，是目前杀毒效果较好的处理工艺。经过臭氧处理后，水中的细菌去除率为99.985%-99.998%，去除有机物40%，色度去除率为77%，亚硝酸盐类去除率为79.5%，类蛋白氨去除率为11.9%。
